How point-of-care testing could drive innovation in global health

The investment in health services in low- and middle-income countries has increased substantially in recent years.1 Such investment has been led by unprecedented efforts to combat major diseases, enabled by the availability of lower-cost and effective drug regimens for treatment and prophylaxis, along with improved vector control. As health services have expanded, so has the demand for diagnostic tests that are essential in identifying patients, determining prognosis, monitoring treatment, and assessing the efficacy of prevention.

Platelet antibodies identification: comparison between two laboratory tests

ABSTRACT Introduction: Platelet antibody identification is indispensable for diagnosing the human platelet antigen (HPA) or human leukocyte antigen (HLA) immunization, mostly because it can restrict the compatibility and results of transfusions. Correct detection of these antibodies is of utmost importance for the diagnosis and treatment. Method: We present 16 platelet alloimmunization results, comparing two tests with different technologies: the MAIPA (monoclonal antibody immobilization of platelet antigens), as a reference technique, and a bead-based assay, the Pak-Lx. Results: Eleven samples (68.75%) showed agreement in both techniques. Two tests were false negatives in the Pak-Lx: a pan-reactivity in GPIIbIIIa and an anti-HPA-9b. On the other hand, the Pak-Lx was more sensitive to detect a decreasing anti-HPA-5b. The Pak-Lx found an anti-HPA-2b positive, but with a low median fluorescent intensity (MFI), suggesting a false-positive result. Moreover, in one case, the MAIPA was negative for a positive Pak-Lx HLA. Conclusion: Antibody platelet diagnosis can sometimes be challenging. The methods seemed similar, the Pak-Lx being faster and simpler than the MAIPA, and they can be complementary to solve clinical issues.

Revisão sistemática: acurácia dos testes laboratoriais complementares para o diagnóstico precoce de hanseníase / Scope review: therapeutic alternatives for the treatment of leprosy in drug-resistant patients

Realizar revisão sistemática avaliando a acurácia de exames laboratoriais complementares para o diagnóstico precoce da hanseníase. Foram incluídos estudos de acurácia que avaliaram exames laboratoriais complementares para diagnóstico precoce de casos de hanseníase. Não houve restrição de língua e foram aplicados os seguintes critérios de inclusão: ƒ Estudos transversais ou caso-controle de acurácia. ƒ Comparação a padrão-ouro: diagnóstico clínico e/ou baciloscopia positiva para M. leprae. ƒ Teste-índice: exames laboratoriais com mais de dois artigos de acurácia publicados. ƒ Artigos com dados suficientes para extração numérica de verdadeiro-positivos (VP), falso-negativos (FN), verdadeiro-negativos (VN) e falso-positivos (FP). ƒ Estudos que forneçam dados separados de forma multibacilar e paucibacilar.

Avaliação da infecção por Parvovírus Humano B19 em diferentes grupos populacionais: diagnóstico diferencial e aspectos imunopatogênicos da infecção aguda e persistente / Evaluation of Human Parvovirus B19 infection in different population groups: differential diagnosis and immunopathogenic aspects of acute and persistent infection

A infecção pelo Parvovírus B19 (B19V) pode ocorrer em indivíduos imunocompetentes e imunocomprometidos, de todas as faixas etárias, e se caracteriza por ser aguda e autolimitada, podendo levar a quadros de doença exantemática (DE), doença febril aguda (DFA), doença renal crônica (DRC) e falência hepática aguda (FHA). O diagnóstico diferencial de B19V nessas populações, muitas vezes, não ocorre e estudos sobre a prevalência do B19V são antigos e escassos, não refletindo a atualidade. Marcadores da infecção podem ser detectados na circulação e em diferentes tipos de tecidos, inclusive em tecidos não eritroides, por meses ou anos. A infecção pode levar a manifestações clínicas graves, que requer tratamento hospitalar, e a doenças inflamatórias atípicas, como: cardiomiopatia, artrite reumatoide, hepatite e vasculite. No entanto, a detecção de B19V DNA não implica necessariamente na presença de vírions infecciosos e na associação do B19V com essas manifestações atípicas. Dessa forma, o objetivo do trabalho foi otimizar técnicas de PCR em tempo real para quantificação do B19V DNA e de detecção de partículas virais infecciosas, a fim de realizar o diagnóstico diferencial da infecção pelo B19V em pacientes com DE, DFA, DRC e FHA. Para o diagnóstico da infecção, amostras de diferentes populações foram testadas: DE (n=54), DFA (n=60), DRC (n=221), e FHA (n=30). Amostras de soro (e de tecido hepático para FHA) foram submetidas a avaliação de marcadores sorológicos (IgM e IgG anti-B19V) e moleculares do B19V, a fim de determinar a fase da infecção em que o paciente se encontrava. Para a avaliação de marcadores moleculares, a metodologia de PCR quantitativo e em tempo real foi otimizada e permitiu um diagnóstico sensível e específico do B19V DNA. Além disso, a presença de vírions em amostras de pacientes com B19V (n=10) e de macacos cynomolgus (n=4) infectados experimentalmente foram avaliadas por meio da técnica de pré-tratamento das amostras com uma enzima endonuclease. O teste molecular (qPCR) otimizado durante o estudo, apresentou sensibilidade e especificidade de 100%. O ensaio com a endonuclease revelou que a maioria das amostras de soro humano tornou-se B19V DNA negativa após o pré-tratamento, indicando que não eram infecciosas. Foi observado prevalências do B19V DNA em 5,5% dos pacientes com DE; 6,6% em DFA; 65,6% em DRC, e 23,3% em FHA. Como conclusão a técnica de qPCR otimizada no presente estudo foi efetiva para o esclarecimento de casos da infecção por B19V e é adequada para diagnóstico diferencial. Além disso, o teste laboratorial baseado em endonuclease possibilitou a discriminação do B19V DNA (se encapsidado em vírions ou não). Portanto, estes testes podem ser utilizados para esclarecer o papel do B19V como agente etiológico associado a diversas manifestações clínicas. As prevalências encontradas nesse estudo indicam que o B19V está circulando entre os diversos grupos populacionais estudados e deve ser feita uma melhor vigilância da infecção, pois está presente tanto em indivíduos imunocompetentes como em imunocomprometidos. Além disso, os resultados sugerem a importância da inclusão de B19V no diagnóstico laboratorial diferencial, não apenas para fins epidemiológicos, mas também para o manejo adequado do paciente.

Parvovirus B19 (B19V) infection can occur in immunocompetent and immunocompromised individuals of all group ages and is characterized as acute and self limiting, which can lead to rash disease (RD), acute febrile illness (AFI), chronic kidney disease (CKD), and acute liver failure (ALF). Differential diagnosis of B19V in these populations often does not occur and studies on the prevalence of B19V are scarce, outdated, and do not reflect the current situation. B19V markers of acute infection can be detected in the circulation and in different tissue types, including non-erythroid tissues, for months to years and may lead to severe clinical manifestations, requiring hospital treatment, and to atypical inflammatory diseases, such as cardiomyopathy, rheumatoid arthritis, hepatitis, and vasculitis. However, the detection of B19V DNA does not necessarily imply the presence of infectious virions and the causal relation between B19V and atypical manifestations could not be proved yet. Thus, the aim of this study was to standardize the real-time PCR for quantification of B19V DNA and detection of infectious viral particles in order to perform the differential diagnosis of the B19V infection in RD, AFI, CKD, and ALF patients. For the diagnosis of the infection, samples from different populations were tested: RD (n=54), AFI (n=60), CKD (n=221), and ALF (n=30). Serum samples (and hepatic tissue for ALF) were submitted to the evaluation of B19V serological status (anti-B19V IgM and IgG antibodies) and molecular markers, in order to determine the stage of infection in which the patient is. For the evaluation of molecular markers, a quantitative real-time PCR methodology was optimized and allowed a sensitive and specific diagnosis of B19V DNA. In addition, the presence of virions in samples from patients with B19V (n=10) and from cynomolgus monkeys (n=4) experimentally infected were evaluated by endonuclease enzyme pretreatment. The molecular test optimized during the study showed 100% sensitivity and specificity. The endonuclease treatment assay revealed that most human serum samples became negative after pretreatment, as indicative of non-infective particles. Concerning the prevalence of B19V DNA: 5.5% were obtained in patients with RD; 6.6% in AFI; 65.6% in CKD, and 23.3% in ALF. In conclusion, the qPCR technique optimized in the present study was effective for clarifying cases of B19V infection and is suitable for differential diagnosis. In addition, the endonuclease-based laboratory test made it possible to discriminate B19V DNA (whether encapsidated in virions or not). Therefore, these tests can be used to clarify the role of B19V as an etiologic agent associated with several clinical manifestations. The prevalence found in this study indicate that B19V is circulating among the different populational groups that have been studied and better surveillance of the infection should be carried out, as it is present in both immunocompetent and immunocompromised individuals. In addition, the results suggest the importance of including B19V in the differential laboratory diagnosis, not only for epidemiological purposes but also for the proper management of the patient.

Recomendações para estratégias nacionais de testagem para SARS-CoV-2 e capacidades diagnósticas. Orientação provisória. 25 de junho de 2021

Esta orientação provisória substitui a orientação da Organização Mundial da Saúde (OMS) intitulada “Recomendações para estratégia de testes laboratoriais para COVID-19”, originalmente publicada em 21 de março de 2020. Esta versão fornece orientações atualizadas sobre a estratégia de testes diagnósticos no contexto de classificações de transmissão atualizadas, saúde pública e medidas sociais, vigilância em saúde pública e definições de caso da OMS para COVID-19. Foram integradas a utilização de novas ferramentas, como testes de diagnóstico rápido de detecção de antígeno (Ag-RDTs) e considerações para testagem de indivíduos vacinados e testagem de mutações genéticas associadas a variantes. Também foram desenvolvidos, para esta versão, anexos que incluem compilação de recursos relevantes e os dez componentes de expansão dos testes subnacionais.

Alterações laboratoriais em gestantes e puérperas com diagnóstico confirmatório de COVID-19 / Laboratory test alterations in pregnant and puerperal women diagnosed with COVID-19

Objetivo: Analisar as alterações de exames laboratoriais de gestantes e puérperas com diagnóstico laboratorial de COVID-19 atendidas em uma maternidade de referência em Fortaleza/Ceará, no período de março a outubro de 2020. Métodos: Trata-se de um estudo retrospectivo, descritivo, com abordagem quantitativa, envolvendo análise de dados dos exames laboratoriais de pacientes com diagnóstico confirmatório para COVID-19 no período de março a outubro de 2020. Os dados foram coletados a partir dos resultados de exames obtidos nas plataformas institucionais, revisão de dados e evoluções do prontuário físico e eletrônico. Resultados: As pacientes apresentaram notória redução de hemoglobina e hematócrito, leucocitose com linfopenia e alteração de parâmetros bioquímicos de função hepática. Na amostra estudada, obteve-se um percentual de óbitos de 5%. Além disso, evidenciou-se alteração de marcadores de inflamação e coagulação, dados que corroboram com os estudos na área. Conclusão: As alterações específicas da COVID-19 foram detectadas nos dois grupos de pacientes, ressaltando-se a importância da realização de novos estudos com enfoque na população gestante e puérpera, pois as consequências da doença nessa população podem afetar diretamente o binômio mãe-bebê.

Objective: To analyze the changes in laboratory tests of pregnant women and postpartum women with a laboratory diagnosis of COVID-19 attended at a reference maternity hospital in Fortaleza / Ceará, from March to October 2020. Methods: This is a retrospective, descriptive study, with a quantitative approach, involving the analysis of data from laboratory tests of patients with a confirmatory diagnosis for COVID-19 in the period from March to October 2020. The data were collected from the results of tests obtained in the institutional platforms as well as data review and evolution physical and electronic medical records. Results: The patients showed a marked reduction in hemoglobin and hematocrit, leukocytosis with lymphopenia and alteration of biochemical parameters of liver function. In the sample studied, a percentage of deaths of 5% was obtained. In addition, changes in inflammation and coagulation markers were evidenced, data that corroborate with studies in the area. Conclusion: Specific changes in COVID-19 were detected in the two groups of patients, emphasizing the importance of conducting further studies focusing on the pregnant and postpartum population, as the consequences of the disease in this population can be applied directly in the mother-child binomial.

Pruebas diagnósticas: Razones de probabilidad / Diagnostic tests: Probability Ratios

La utilidad de una prueba diagnóstica se cuantifica mediante el cálculo de las medidas de probabilidad y las medidas de razones de probabilidad. Las medidas de probabilidad son la sensibilidad, la especificidad, valor predictivo positivo y el valor predictivo negativo. La sensibilidad y la especificidad se usan para escoger la mejor prueba a utilizar, entre varias disponibles; sin embargo, no pueden ser utilizadas para estimar la probabilidad de determinada enfermedad en un paciente en particular. En la práctica clínica es esencial saber cuál es la probabilidad de que un paciente con un resultado positivo en una prueba diagnóstica presente la enfermedad y cuál es la probabilidad de que un paciente con un resultado negativo en una prueba diagnóstica no presente la enfermedad. Los valores predictivos positivos y negativos nos brindan la respuesta a esta cuestión, sin embargo, dependen tanto de la sensibilidad y especificidad, como de la prevalencia de la enfermedad en la muestra del estudio. Las medidas de razones de probabilidad también describen el rendimiento o utilidad de una prueba diagnóstica y poseen dos propiedades importantes: resumen el mismo tipo de información que la sensibilidad y la especificidad, y pueden utilizarse para calcular la probabilidad de la enfermedad después de una prueba positiva o negativa. El propósito de esta publicación fue definir el concepto de razones de probabilidad, exponer sus principales fortalezas y explicar cómo se calculan las razones de probabilidad cuando la prueba de interés expresa sus resultados en forma dicotómica, en más de dos categorías o de forma ordinal

The usefulness of a diagnostic test is quantified by calculating the probability measures and the probability ratio measures. Probability measures are sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value. Sensitivity and specificity are used to choose the best test to use, among several available; however, they cannot be used to estimate the probability of a certain disease in a particular patient. In clinical practice it is essential to know what is the probability that a patient with a positive result in a diagnostic test will present the disease and what is the probability that a patient with a negative result in a diagnostic test will not present the disease. The positive and negative predictive values provide us with the answer to this question, however, it depends both on the sensitivity and specificity, and on the prevalence of the disease in the study sample. Probability ratio measures also describe the performance or usefulness of a diagnostic test and possess two important properties: they summarize the type of information that sensitivity and specificity, and they can be used to calculate the probability of disease after a positive or positive test. negative. The purpose of this publication was to define the concept of probability ratio measures, expose its main strengths, and explain how probability ratio measures are calculated when the test of interest expresses its results dichotomously, in more than two categories or ordinally

Pruebas diagnósticas: Fundamentos de los estudios diagnósticos, evaluación de la validez e interpretación clínica de sus resultados / Diagnostic tests: Fundamentals of diagnostic studies, validityassessment and clinical interpretation of the results

El propósito de esta publicación es describir los fundamentos de los estudios diagnósticos, proporcionando elementos de juicio para evaluar la validez, puntualizar sobre las medidas de utilidad o rendimiento de las mismas y resaltar la importancia de los estudios diagnósticos en la práctica clínica usual. Dentro de los fundamentos de las pruebas diagnósticas se explican los principios básicos sobre las pruebas diagnósticas, la estructura de estas y se detalla cómo se analizan los resultados de la prueba diagnóstica de interés y los resultados de la prueba diagnóstica de referencia. Se evalúa la validez de una prueba diagnóstica examinando tres criterios importantes que sustentan la solidez metodológica de este tipo de estudio: representatividad, constatación y determinación. Por otro lado, se estudia el primer tipo de medidas de rendimiento de una prueba diagnóstica, las medidas de probabilidad (sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo, valor predictivo negativo). Cuando los resultados de una prueba diagnóstica son expresados en una escala cuantitativa continua es necesario escoger "el mejor punto de corte" que se corresponda con una alta sensibilidad y especificidad, para así distinguir los enfermos de los sanos. Con este fin, podemos utilizar las propiedades de la curva COR (acrónimo de Característica Operativa del Receptor). En la presente publicación se describe y pormenoriza la construcción de la curva COR y se puntualiza sobre la mejor manera de analizarla y sacarle provecho. Por último, se ilustra cómo un estudio diagnóstico cambia el paradigma de manejo de una enfermedad

The purpose of this publication is to describe the fundamentals of diagnostic studies, providing elements of judgment to evaluate their validity, to point out their usefulness or performance measures, and to highlight the importance of diagnostic studies in usual clinical practice. Within the fundamentals of diagnostic tests, the basic principles of diagnostic tests, their structure, and how the results of the diagnostic test of interest and the results of the reference diagnostic test are analyzed and explained. The validity of a diagnostic test is eva-luated by examining three important criteria that support the methodological soundness of this type of study: representativeness, verification, and determination. On the other hand, the first type of performance measures of a diagnostic test are studied, the probability measures (sensitivity, specificity, positive predictive value, ne-gative predictive value). When the results of a diagnostic test are expressed on a continuous quantitative scale, it is necessary to choose the best cut-off point that corresponds to high sensitivity and specificity, in order to distinguish the sick from the healthy. To this end, we can use the properties of the ROC (Receiver Operating Characteristics) curve. In this publication, the construction of the ROC curve is described and detailed, and the best way to analyze it and take advantage of it is specified. Finally, it illustrates how a diagnostic study changes the paradigm of disease management

Blood parameters of crioulo breed horse / Parâmetros sanguíneos de potros da raça Crioula

Plasma levels of hematocrit, total plasma protein, fibrinogen, creatine phosphokinase, aspartate transferase, and lactate were analyzed in blood samples of 85 Crioula breed foals, from birth to two years of age. The animals were divided into age groups: G1 (up to 15 days of age; n=70), G2 (from 16 days to one month of age; n=67), G3 (between one and three months of age; n=75), G4 (between three and six months of age; n=64), G5 (between six and nine months of age; n=59), G6 (between nine and 18 months of age; n=39), and G7 (between 18 months and two years of age; n=17). These groups were statistically analyzed by one-way variance analysis (ANOVA) and Tukey's test. Male and female means were compared by Student's t-test. Hematocrit levels were significantly higher up to 90 days of age and in G7 females. Total plasma proteins increased significantly in groups 3, 4, 6, and 7. The highest fibrinogen levels were found in G1. Yet for creatine phosphokinase, the highest concentrations were detected in G5, whereas those of aspartate aminotransferase in G7. The levels of this enzyme remained similar from 30 days to two years of age. Lactate concentrations were higher in G3. We concluded that the sex of the animal had no significant effect on laboratory test interpretations. By contrast, the age of the animal should be considered since relevant variations were observed with time. Nevertheless, specific tables for each analysis should be consulted for interpretation of results.

Com o propósito de estabelecer valores de hematócrito, proteínas plasmáticas totais, fibrinogênio, creatina quinase , aspartato transferase e lactato em potros da raça Crioula, do nascimento até os dois anos, utilizaram-se amostras sanguíneas de 85 animais, divididos pela estratificação etária: Grupo 1 (G1) Até 15 dias de vida (n=70); grupo 2 (G2), entre 16 dias até um mês (n=67); grupo 3 (G3), entre 1 e 3 meses (n=75); grupo 4 (G4), entre 3 e 6 meses (n=64); grupo 5 (G5), entre 6 e 9 meses (n=59); grupo 6 (G6), entre 9 e 18 meses (n=39); e grupo 7 (G7), entre 18 meses até 2 anos (n=17). Foi realizado estudo estatístico entre os grupos pela análise de variância unidirecional (one-wayANOVA), complementada pelo teste de Tukey. Para comparação das médias entre os sexos utilizou-se o teste t de Student. O hematócrito foi significativamente mais elevado até os 90 dias e nas fêmeas do G7. Para proteínas plasmáticas totais, notou-se aumento significativo nos grupos 3, 4, 6 e 7. Os valores de fibrinogênio foram maiores no G1. A CK apresentou maior concentração no G5 e a AST no G7. A AST assumiu valores semelhantes dos 30 dias até os 2 anos. A concentração de lactato foi mais elevada no G3. Conclui-se que na interpretação dos exames laboratoriais de potros da raça crioula, o gênero não interfere significativamente nos resultados, porém a idade deve ser considerada devido à ocorrência de variações relevantes. Recomenda-se que para interpretação sejam consultadas tabelas específicas para cada análise.

Intervalo de tempo decorrido entre o início dos sintomas e a realização do exame para COVID-19 nas capitais brasileiras, agosto de 2020* / Intervalo de tiempo entre el inicio de los síntomas y el examen de COVID-19 en las capitales brasileñas, agosto de 2020 / Time interval between onset of symptoms and COVID-19 testing in Brazilian state capitals, August 2020

Objetivo: Analisar as notificações de síndrome gripal segundo o intervalo de tempo decorrido entre início dos sintomas e realização do exame para COVID-19. Métodos: Estudo transversal, utilizando registros de casos de síndrome gripal contendo resultados de testes diagnósticos da COVID-19 nas capitais brasileiras e no Distrito Federal, no sistema e-SUS Notifica, entre 1º/março/2020 e 18/agosto/2020. Comparou-se o intervalo de tempo entre início dos sintomas e realização do exame (teste ANOVA), classificando-o segundo a adequação/oportunidade do exame. Resultados: Entre 1.942.514 notificações, o tempo médio entre início dos sintomas e execução dos testes foi de 10,2 dias (±17,1). Entre testados, predominou o sexo feminino (55,1%), idade de 20-39 anos (43,8%) e região Sudeste (43,0%). O teste ELISA IgM foi realizado em tempo adequado para 58,8%; e o teste rápido-antígeno, em tempo inadequado para 68,0%. Conclusão: Observou-se inadequação entre início dos sintomas e realização dos testes para COVID-19 nas regiões brasileiras.

Objetivo: Analizar las notificaciones de síndrome gripal según el intervalo de tiempo entre el inicio de los síntomas y el examen de COVID-19. Métodos: Estudio transversal utilizando registros de casos de síndrome gripal que contienen resultados de pruebas diagnósticas de COVID-19 en las capitales brasileñas y el Distrito Federal del sistema e-SUS Notifica, entre 1/marzo/2020 y 18/agosto/2020. El intervalo de tiempo se comparó entre el inicio de los síntomas y la realización del examen mediante la prueba ANOVA, clasificándolo según la adecuación/ oportunidad del examen. Resultados: Entre 1.942.514 notificaciones, el tiempo promedio entre el inicio de los síntomas y la ejecución del examen fue de 10,2 días (±17,1). Entre los evaluados, predominaron las mujeres (55,1%), 20-39 años (43,8%) y la región Sudeste (43,0%). El ELISA IgM se realizó en momento adecuado para 58,8% y la prueba de Antígeno Rápido en momento inadecuado para 68,0%. Conclusión: Se constata inadecuación de tiempo entre el inicio de los síntomas y las pruebas para COVID-19 en las regiones brasileñas.

Objective: To analyze notifications of flu-like syndrome according to the time interval between onset of symptoms and testing for COVID-19. Methods: This was a cross-sectional study using records of flu-like syndrome cases containing results of COVID-19 diagnostic tests in the Brazilian state capitals and Federal District, held on the e-SUS Notifica system, from March 1st, 2020 to August 18th, 2020. The time interval between symptom onset and testing was compared using the ANOVA test, classifying it according to test adequacy/timeliness. Results: Taking 1,942,514 notifications, average time between symptom onset and testing was 10.2 days (±17.1). Among those tested, females (55.1%), people aged 20-39 years (43.8%), and the Southeast region of Brazil (43.0%) predominated. 58.8% of IgM ELISA tests were performed at an adequate time while 68.0% of rapid antigen tests were not performed at an adequate time. Conclusion: Inadequacy was found between symptom onset and time taken to test for COVID-19 in the Brazilian regions.

O efeito da testagem laboratorial nos indicadores de acompanhamento da COVID-19: uma análise dos 50 países com maior número de casos / El efecto de las pruebas de laboratorio en los indicadores de seguimiento de COVID-19: un análisis de los 50 países con el mayor número de casos / The effect of laboratory testing on COVID-19 monitoring indicators: an analysis of the 50 countries with the highest number of cases

Objetivo: Analisar como a testagem da população influencia os indicadores de saúde usados para monitorar a pandemia de COVID-19 nos 50 países com maior número de casos diagnosticados. Métodos: Estudo ecológico sobre dados secundários, extraídos em 19/08/2020. Foram calculadas incidência acumulada, taxa de mortalidade, letalidade e proporção de testes positivos. Os dados foram descritos e apresentados graficamente, com o respectivo coeficiente de correlação de Spearman. Resultados: A taxa de testagem variou enormemente entre os países. A incidência acumulada e a proporção de testes positivos foram correlacionadas ao número de testes, enquanto a taxa de mortalidade e a letalidade apresentaram correlação baixa com esse indicador. Conclusão: A maioria dos países não testa o suficiente para garantir adequado monitoramento da pandemia, com reflexo na qualidade dos indicadores. A ampliação do número de testes é fundamental; porém, ela deve ser acompanhada de outras medidas, como isolamento de casos diagnosticados e rastreamento de contatos.

Objetivo: Analizar cómo el testeo poblacional influye en los indicadores de salud utilizados para monitorear la pandemia de COVID-19 en los 50 países con mayor número de casos diagnosticados. Métodos: Estudio ecológico, con datos secundarios, recogidos el 19/8/2020. Se calcularon la incidencia acumulada, la tasa de mortalidad, la letalidad y la proporción de pruebas positivas. Los datos fueron descritos y presentados gráficamente, con el respectivo Coeficiente de Correlación de Spearman. Resultados: La tasa de testeo varió enormemente entre los países. La incidencia acumulada y la proporción de pruebas positivas se correlacionaron con el número de pruebas, mientras que la tasa de mortalidad y de letalidad mostraron una baja correlación con este indicador. Conclusión: La mayoría de los países no realizan suficientes pruebas para garantizar un seguimiento adecuado de la pandemia, lo que se refleja en la calidad de los indicadores. La ampliación del número de pruebas es fundamental, y debe ir acompañada de aislamiento de casos y seguimiento de contactos.

Objective: To analyse how testing the population influences the health indicators used to monitor the COVID-19 pandemic in the 50 countries with the highest number of diagnosed cases. Methods:This was an ecological study using secondary data retrieved on 8/19/2020. Cumulative incidence, mortality rate, case-fatality rate, and proportion of positive tests were calculated. The data were described and presented graphically, with their respective Spearman Correlation Coefficients. Results: The testing rate varied enormously between countries. Cumulative incidence and the proportion of positive tests were correlated with the number of tests, while the mortality rate and case-fatality rate showed low correlation with this indicator. Conclusion: Most countries do not test enough to ensure adequate monitoring of the pandemic, and this is reflected in the quality of the indicators. Expanding the number of tests is essential, but it needs to be accompanied by other measures, such as isolation of diagnosed cases and contact tracing.

Suspected infection, absenteeism at work and testing for COVID-19 among nursing professionals / Sospecha de infección, ausentismo laboral y pruebas de detección de COVID-19 entre profesionais de enfermería / Suspeita de infecção, abstenção no trabalho e testagem para COVID-19 entre profissionais de enfermagem

ABSTRACT Objective: to identify the occurrence of the factors associated with: (1) suspected infection by the virus that causes COVID-19; (2) absenteeism at work due to suspected infection or diagnosis of infection by the virus that causes COVID-19; and (3) performance of tests for the screening of infection by the virus that causes COVID-19 among Nursing professionals. Method: a cross-sectional study conducted with 890 nurses in June and July 2020. The associations between the outcomes and the other variables were explored using Poisson regression models with robust variance estimators. Results: occurrence of the outcomes was (1) 35.5%, (2) 16.2% and (3) 38.2%, respectively. For suspected infection, associations were observed with assessment of the working conditions as deficient (RR: 1.55; 95% CI: 1.21-1.99) and with lack of Personal Protective Equipment (RR: 1.27; 95% CI: 1.06-1.51). Absenteeism at work was associated with the adoption of moderate social distancing (RR: 1.49; 95% CI: 1.00-2.21). To perform the screening tests, the associations with links to outpatient (RR: 2.47; 95% CI: 1.52-4.01) and hospital (RR: 2.49; 95% CI: 1.60-3.89) services stood out, in addition to direct contact with patients with confirmed COVID-19 diagnoses (RR: 1.65; 95% CI: 1.33-2.05). Conclusion: despite the high occurrence of suspected infection and a considerable incidence of absenteeism at work among professionals from the various services under study, disparity in access to the screening tests was evidenced, especially with regard to the professionals who work in Primary Care.

RESUMEN Objetivo: identificar la incidencia y los factores asociados con: (1) sospecha de infección por el virus que causa COVID-19; (2) ausencia laboral debido a sospecha o diagnóstico de infección por el virus que causa COVID-19; y (3) pruebas para detectar la infección por el virus que causa COVID-19 entre profesionales de Enfermería. Método: estudio transversal realizado con 890 profesionales de Enfermería durante los meses de junio y julio de 2020. Las asociaciones entre los resultados y las demás variables se estudiaron por medio de modelos de regresión de Poisson con estimadores robustos de varianza. Resultados: la incidencia de los resultados fue: (1) 35,5%, (2) 16,2% y (3) 38,2%. Para la sospecha de infección, se observaron asociaciones con condiciones de trabajo evaluadas como deficientes (RR: 1,55; IC 95%: 1,21-1,99) y con la falta de Equipos de Protección Personal (RR: 1,27; IC 95%: 1,06-1,51). La ausencia laboral se asoció con la adopción de distanciamiento social moderado (RR: 1,49; IC 95%: 1,00-2,21). Para llevar adelante las pruebas de detección, se destacaron las asociaciones con la vinculación a servicios ambulatorios (RR: 2,47; IC 95%: 1,52-4,01) y hospitalarios (RR: 2,49; IC 95%: 1,60-3,89), además del contacto directo con pacientes con diagnósticos confirmados da COVID-19 (RR: 1,65; IC 95%: 1,33-2,05). Conclusión: pese a la elevada incidencia de sospechas de infección y una considerable cantidad de ausencias laborales entre profesionales de los diversos servicios estudiados, se evidenció cierta disparidad en el acceso a las pruebas de detección, especialmente en lo que se refiere a los profesionales de Atención Primaria.

RESUMO Objetivo: identificar a ocorrência e os fatores associados a: (1) suspeita de infecção pelo vírus causador da COVID-19; (2) abstenção no trabalho devido a suspeita ou ao diagnóstico de infecção pelo vírus causador da COVID-19 e (3) realização de testes para o rastreio de infecção pelo vírus causador da COVID-19 entre profissionais de Enfermagem. Método: estudo transversal realizado com 890 enfermeiros entre os meses de junho e julho de 2020. As associações entre os desfechos e as demais variáveis foram exploradas com a utilização de modelos de regressão de Poisson com estimadores robustos de variância. Resultados: a ocorrência dos desfechos foi de (1) 35,5%, (2) 16,2% e (3) 38,2%. Para a suspeita de infecção, foram observadas associações com a avaliação das condições de trabalho como ruins (RR: 1,55; IC 95%: 1,21-1,99) e a falta de equipamentos de proteção individual (RR: 1,27; IC 95%: 1,06-1,51). A abstenção do trabalho esteve associada com a adoção de distanciamento social moderado (RR: 1,49; IC 95%: 1,00-2,21). Para a realização de testes de rastreio, destacam-se as associações com a vinculação a serviços ambulatoriais (RR: 2,47; IC 95%: 1,52-4,01) e hospitalares (RR: 2,49; IC 95%: 1,60-3,89), além do contato direto com pacientes confirmadamente acometidos pela COVID-19 (RR: 1,65; IC 95%: 1,33-2,05). Conclusão: apesar da elevada ocorrência de suspeitas de infecção e um número considerável de abstenção do trabalho entre profissionais dos diversos serviços estudados, foi evidenciada uma disparidade no acesso aos testes de rastreio, especialmente no que se refere aos profissionais da Atenção Primária.

Características clínicas e laboratoriais da COVID-19: uma análise na internação / Hospitalar clinical and laboratory characteristics for COVID-19: analysis of hospital internment

Objetivo: Analisar as características clínicas e laboratoriais de pacientes com COVID-19 na internação hospitalar. Métodos: Foram incluídos no estudo pacientes com diagnóstico de COVID-19 internados em uma Unidade de Pronto Atendimento e em um Hospital Municipalde referência para a doença. Os dados foram coletados dos prontuários eletrônicos dos pacientes. Aplicou-se a estatística descritiva. Resultados:Foram incluídos 205 pacientes. Os sinais e sintomas clínicos mais frequentes foram dispneia (48,29%), tosse (30,73%) e mialgia (24,39%). A hipertensão arterial sistêmica foi a comorbidade predominante (73,47%). A maioria dos pacientes apresentou linfopenia (73,12%), elevação na proteína C reativa (97,53%), aumento de desidrogenase láctica (94,52%) e redução na pO2 (69,00%). Conclusões:Os dados gerados possibilitaram determinar o perfil clínico e laboratorial de pacientes com COVID-19 na internação hospitalar. Esses resultados podem contribuir para uma melhor compreensão da patogenia da doença.

Objective: Toanalyze the clinical and laboratory characteristics of patients with COVID-19 in hospitalization. Methods:Patientsdiagnosed with COVID-19 and admitted in a Health Care Unit and in a specialized Municipal Hospital were included. Data were retrieved from the patients ́ electronic charts and descriptive statistics were employed.Results:205 patients were included. The most frequent clinical symptoms comprised dyspnoea (48.29%), coughs (30.73%) and myalgia (24.39%). Systemic arterial hypertension was the dominant co-morbidity (73.47%). Most patients also had lymphopenia (73.12%), rise in reactive protein C (97.53%), increase in lactic dehydrogenase (94.52%) and decrease in pO2 (69.00%). Conclusions:Data retrieved determined the clinical and laboratory profile of patients with COVID-19 at hospitalization. Results may contribute towards a better analysis of the disease ́s pathogeny.

Large scale use of SARS-CoV-2 antigen-based detection tests: a three-month experience in Guatemala, June-August 2020

[ABSTRACT]. Objectives. To measure protocol adherence and antigen-based detection tests (AgDT) negative predictive value after 3 months of massive use as a diagnostic tool for COVID-19 in Guatemala. Methods. The study period included nasopharyngeal swabs taken between March 12 and August 31, 2020, which results were entered in the national COVID-19 information system. Proportional increase in testing between one month before and one month after the introduction of AgDT (May 9–June 8 vs. June 9–July 8) was measured. Results. After AgDT introduction, there was a 139% increase in SARS-CoV-2 testing. Between June 9 and August 31, 7.8% of 110 657 AgDT-negative patients had follow-up RT-PCR testing. Of them, 30% were RT-PCR positive. Conclusions. While introducing AgDT improved access to diagnostics, ensuring the availability of timely RT-PCR capacities to confirm diagnosis is also key.

[RESUMEN]. Objetivos. Evaluar la adherencia al protocolo y el valor predictivo negativo de las pruebas de detección basadas en antígeno (AgDT) después de 3 meses de uso masivo como método diagnóstico para la COVID-19 en Guatemala. Métodos. Se estudiaron hisopados nasofaríngeos tomados entre el 12 de marzo y el 31 de agosto de 2020, cuyos resultados constaban en el sistema de información nacional de COVID-19. Se midió el aumento proporcional del número de pruebas entre un mes antes y un mes después de la introducción de las AgDT (9 de mayo a 8 de junio, frente a 9 de junio a 8 de julio). Resultados. Después de la introducción de AgDT hubo un aumento del 139% en el número de pruebas de SARS-CoV-2. Entre el 9 de junio y el 31 de agosto, el 7,8% de 110 657 pacientes negativos según una AgDT se sometieron a una prueba de seguimiento con RT-PCR. De ellos, el 30% presentó una RT-PCR positiva. Conclusiones. Aunque la introducción de AgDT mejoró el acceso al diagnóstico, también es clave asegurar la disponibilidad oportuna de RT-PCR para confirmar el diagnóstico.

Consenso de grupo Ad-hoc sobre recomendaciones para la evaluación y controles de calidad para el diagnóstico molecular y serológico de la infección humana por SARS CoV-2 / Ad-hoc group consensus recommendations on the evaluation and quality control of molecular and serological diagnostics tests for SARS CoV-2 human infection

Se formulan recomendaciones de un grupo de consenso de expertos sobre los criterios para evaluar el desempeño diagnóstico (tamaño y selección de muestras para sensibilidad y especificidad analíticas, criterios para establecer límites de detección, criterios para establecer el estándar de oro para las serologías) que deberían ser tenidos en cuenta al evaluar y validar las pruebas diagnósticas para SARS CoV-2. Con el propósito de asegurar la calidad de las pruebas serológicas a utilizar en el país, se recomienda la participación en un programa de control de calidad externo, que garantice la idoneidad y desempeño en la realización de las pruebas diagnósticas serológicas y moleculares durante esta pandemia, ya que su uso tiene profundas implicaciones para las medidas de intervención clínicas individuales y de seguimiento y control en salud pública.

We formulate recommendations from a consensus working group on the criteria to evaluate the diagnostic performance (size and criteria of selection of samples to determine sensitivity, analytical specificity, criteria for limit of detection, criteria for gold standard to evaluate serological assays) that should be taken into account during the evaluation and validation/verification of diagnostic tests for SARS CoV-2 infection. A national external quality control program should be established to guarantee the suitability and performance of these diagnostic serological and molecular tests during this pandemic, that will have deep implications for decisions on clinical and public health.

Testes de diagnóstico para SARS-CoV-2. Guia provisória.11 setembro 2020

[Introdução]. Este documento fornece orientações provisórias para laboratórios e outras partes interessadas envolvidas no diagnóstico da síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2). As principais considerações para a coleta de amostras, teste de amplificação de ácido nucleico (NAAT), antígeno (Ag), detecção de anticorpos (Ab) e garantia de qualidade são abordados WHElab@who.int. Alterações da versão anterior: O título desta guia provisória mudou de “Testes de laboratório para COVID-19 em casos humanos suspeitos” para “Testes de diagnóstico para SARS-CoV-2”. Informações adicionais relevantes e um algoritmo de diagnóstico clínico foram adicionados ao documento. Além disso, a guia foi atualizada com novas descobertas da literatura e melhores práticas.

Diretrizes para laboratórios sobre detecção e diagnóstico da infecção pelo vírus COVID-19 / Laboratory Guidelines for the Detection and Diagnosis of COVID-19 Virus Infection

[Introdução]: Em janeiro de 2020, o agente etiológico responsável por um agregado de casos (cluster) de pneumonia grave em Wuhan, China, foi identificado como sendo um novo betacoronavírus, diferente do SARS-CoV e MERS-CoV. Em 11 de fevereiro de 2020, o Comitê Internacional de Taxonomia Viral (ICTV) anunciou que o vírus foi denominado novo coronavírus que causa síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2). Porém, no mesmo dia, a OMS denominou a doença como doença do novo coronavírus COVID-19. Para fins de comunicação, iremos nos referir ao vírus como “o vírus responsável pela COVID-19” ou “o vírus COVID-19”. Sequências genômicas completas do vírus COVID-19 foram publicadas e diferentes protocolos de detecção molecular foram desenvolvidos, porém não estão totalmente validados ainda. No entanto, dada a atual circulação do vírus COVID-19 na região das Américas, a Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde (OPAS/OMS) recomenda aos Estados Membros que garantam a identificação oportuna de casos suspeitos, a coleta e envio de amostras a laboratórios de referência, e a implementação de protocolos de detecção molecular, de acordo com a capacidade do laboratório. Em 19 de março de 2020, a OMS atualizou sua orientação provisória sobre os testes laboratoriais para doença do novo coronavírus (COVID-19) em casos suspeitos em humanos, que incluía informações sobre coleta e envio de amostras, testes laboratoriais e notificação de casos e resultados de testes. A OMS também atualiza as definições de casos suspeitos conforme necessário.

Testes diagnóstico - COVID-19 / Diagnostic tests - COVID-19

Síntese de evidências sobre testes para diagnóstico rápido do Coronavírus, cita os principais métodos usados em todo o mundo e os testes adotados no Brasil

Synthesis of evidence on tests for rapid diagnosis of Coronavirus, cites the main methods used worldwide and the tests adopted in Brazil